Opporunités de recherche

Vous êtes intéressés par l'étude des eaux douces? Voir ci-dessous pour les postes à combler dans les différents laboratoires.

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Projet de recherche de niveau Maîtrise (MSc)
MicroGeoNx: caractériser les corps géologiques profonds à l’aide d’ADN appartenant à des communautés microbiennes endolithiques

PI: Cassandre Lazar (UQAM)
Un projet de recherche niveau Maîtrise est disponible au département des Sciences Biologiques, Université du Québec à Montréal (UQAM), au sein du laboratoire de Cassandre Lazar. Ce projet sera mené en partenariat avec les compagnies Derena Geosciences, Exploration Midland, Mine Raglan (Glencore), Nouveau Monde Graphite et Ressources Utica Forages.

Dans les couches terrestres souterraines (100 m à 3 km sous nos pieds), des microbes peuvent vivre enfouis dans des matrices rocheuses compactes. La composition des espèces vivantes dans des couches distinctes est unique et indicative de leur environnement. Au Québec, une région riche en minéraux et en gaz, l’industrie minière est en plein essor et recherche des méthodes novatrices pour explorer de nouveaux sites rapidement, efficacement et à faible coût. Dans le cadre de ce projet, nous utiliserons les profils génomiques de communautés microbiennes vivant à l’intérieur des noyaux rocheux fournis par les entreprises minières pour analyser les conditions retrouvées dans ces roches, notamment la minéralogie, l’âge et la succession des couches. Nous construirons une vaste base de données en génomique microbienne en utilisant des outils moléculaires (extraction d’ADN et séquençage amplicon et shotgun). Nous tenterons également d’extraire et séquencer l’ARN de certains échantillons. Enfin, nous mettrons en cultures les microorganismes endolithiques d’échantillons provenant d’échantillons forés et récoltés au cours du projet.

La/le candidat(e) retenu(e) profitera d'un environnement de travail et de recherche dynamique au sein des centres de recherche du Groupe de recherche interuniversitaire en limnologie (GRIL) et du Centre de recherche en dynamique du système terrestre (GEOTOP), deux regroupements stratégiques du FRQNT (Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies)

La/le candidat(e) retenu(e) devra idéalement posséder un baccalauréat en biologie, microbiologie, ou sciences de l'environnement, saura démontrer un potentiel en recherche, et montrera un intérêt vif pour l'écologie microbienne et la biogéochimie. De l'expérience dans les domaines de la microbiologie, biologie moléculaire, analyses statistiques, et bioinformatique seront considérés être un atout.

La date d’entrée en fonction est 1er Avril 2024. Le/la postulant(e) intéressé(e)s sont prié(e)s d’envoyer une lettre de motivation (1 page maximum), et un CV à :

Cassandre Lazar , Professeure adjointe
Département des Sciences Biologiques, Université du Québec à Montréal (UQAM)
Courriel: lazar.cassandre@uqam.ca
Tel: 514-987-3000 ext. 3963

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Projet de recherche au niveau postdoctoral
MicroGeoNx: une nouvelle approche pour caractériser les corps géologiques profonds à l’aide d’ADN appartenant à des communautés microbiennes endolithiques

PI: Cassandre Lazar (UQAM)
Un projet de recherche niveau postdoctoral est disponible au département des Sciences Biologiques, Université du Québec à Montréal (UQAM), au sein du laboratoire de Cassandre Lazar. Ce projet sera mené en partenariat avec les compagnies Derena Geosciences, Exploration Midland, Mine Raglan (Glencore), Nouveau Monde Graphite et Ressources Utica Forages.

Dans les couches terrestres souterraines (100 m à 3 km sous nos pieds), des microbes peuvent vivre enfouis dans des matrices rocheuses compactes. La composition des espèces vivantes dans des couches distinctes est unique et indicative de leur environnement. Au Québec, une région riche en minéraux et en gaz, l’industrie minière est en plein essor et recherche des méthodes novatrices pour explorer de nouveaux sites rapidement, efficacement et à faible coût. Dans le cadre de ce projet, nous utiliserons les profils génomiques de communautés microbiennes vivant à l’intérieur des noyaux rocheux fournis par les entreprises minières pour analyser les conditions retrouvées dans ces roches, notamment la minéralogie, l’âge et la succession des couches. Nous construirons une vaste base de données en génomique microbienne en utilisant des outils moléculaires (extraction d’ADN et séquençage amplicon et shotgun). Nous tenterons également d’extraire et séquencer l’ARN de certains échantillons. Enfin, nous mettrons en cultures les microorganismes endolithiques d’échantillons provenant d’échantillons forés et récoltés au cours du projet.

La/le candidat(e) retenu(e) profitera d'un environnement de travail et de recherche dynamique au sein des centres de recherche du GRIL (Groupe de recherche interuniversitaire en limnologie) et du Geotop (Centre de recherche en dynamique du système terrestre), deux regroupements stratégiques du FRQNT (Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies).

La/le candidat(e) retenu(e) devra idéalement posséder un doctorat en écologie microbienne, microbiologie, ou sciences de l'environnement, saura démontrer un potentiel en recherche, et montrera un intérêt vif pour l'écologie microbienne et la biogéochimie. De l'expérience dans les domaines de la microbiologie, biologie moléculaire, analyses statistiques, et bioinformatique seront considérés être un atout.

La date d'entrée en fonction est avril 2024 et le projet aura une durée de 2 ans. La/le postulant(e) intéressé(e) est prié d'envoyer une lettre de motivation (1 page maximum) décrivant son parcours académique et ses intérêts de recherche, et un CV à :
Cassandre Lazar, Professeure agrégée, Département des Sciences Biologiques, UQAM
lazar.cassandre@uqam.ca

Poste PhD en écotoxicologie aquatique: Toxicité relative des métaux de différentes classes sur le crustacé d'eau douce Daphnia magna: modélisation, interaction et partitions subcellulaires

PIs: Maikel Rosabal (UQAM), Isabelle Lavoie (INRS) et Claude Fortin (INRS)
Sommaire La modélisation de la toxicité relative des métaux basée sur la relation entre leur structure chimique et leur activité biologique est un excellent moyen d'estimer la toxicité des métaux, en particulier ceux pour lesquels les informations toxicologiques sont insuffisantes, voire inexistantes. C'est le cas de plusieurs métaux critiques pour la transition écologique urgemment nécessaire pour faire face aux défis environnementaux actuels, qui ne font pas l'objet d'une réglementation environnementale. Afin de contribuer au développement de tels outils prédictifs, ce projet de doctorat a pour objectif de générer un ensemble de connaissances sur la toxicité subchronique, le type d'interactions et le comportement toxique (au niveau subcellulaire et moléculaire) d'une série de contaminants comprenant des métaux de classe A (La, Ce, U), B (Ag, Cu, Pd) et limite (Ni, Co) dans le crustacé d'eau douce Daphnia magna afin de relier leurs caractéristiques chimiques au comportement toxique observé.
Ce projet applique des approches innovantes en toxicologie, en modélisation environnementale, en métallomique, etc, métallomique, telles que l'approche du partage subcellulaire des métaux et les techniques hybrides (par exemple, SEC-ICP-QQQ ; RP-HPLC ICP-QQQ). Le candidat aura accès à des plateformes analytiques de pointe situées dans les deux universités. Cette recherche contribuera au développement d'une compréhension approfondie et rigoureuse de la toxicité des métaux, nécessaire pour anticiper l'impact des métaux sur les écosystèmes aquatiques. Tous les résultats attendus dans ce projet ont le potentiel d'accélérer la mise en place d'outils prédictifs dans la régulation environnementale des contaminants émergents.
Exigences
- Répondre aux critères d'admissibilité du programme de recherche de doctorat en biologie offert par l'UQAM.
- Expérience et compétences en chimie environnementale, biochimie, biologie, toxicologie, chimie analytique ou autres domaines connexes, biochimie, biochimie, biologie, toxicologie, chimie analytique ou autres domaines connexes
- Bonnes compétences en travail de laboratoire
- Intérêt marqué pour la recherche scientifique et la toxicité environnementale
- Connaissance du français et/ou de l'anglais parlé et écrit
Financement : Bourse de doctorat pour 4 ans.
Les candidats doivent envoyer :
- Un CV actualisé (format pdf), incluant les projets et travaux académiques en préparation.
- Des relevés de notes non officiels (BSc, MSc)
- Une description des intérêts de recherche et de l'expérience pertinente pour le poste.
- Des lettres de recommandation ou les coordonnées de deux références potentielles.
Date de clôture des candidatures : 1er juin 2023 (de préférence) Une fois toutes les candidatures reçues, le processus de sélection débutera et se poursuivra jusqu'à ce que le poste soit pourvu.
Contact: Maikel Rosabal
Date de début: Septembre 2023 (négotiable)

Poste PhD en écotoxicologie aquatique

PI: Maikel Rosabal
Ce projet applique des approches liées à l'environnement protéomique et métallomique, comme le métal subcellulaire, l'approche de partitionnement et les techniques hybrides (par exemple, SEC-ICP-QQQ ; RP-HPLC ICPQQQ). Le candidat aura accès à des plateformes analytiques avancées situées dans les deux les universités. Cette recherche révélera des informations sur les mécanismes moléculaires et subcellulaires et les mécanismes par lesquels les métaux traces interagissent et exercent des effets délétères, et identifieront biomarqueurs potentiels de toxicité ou d'exposition à des mélanges de métaux. Tous ces résultats seront contribuer grandement au développement de modèles plus fiables et réalistes pour prédire effets potentiels des éléments traces dans les systèmes aquatiques.

Pour plus d'informations, cliquez ici
Date de début: Automne 2022

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Biogéochimie du carbone aquatique des écosystèmes aquatiques boréaux

PI: Prof Paul del Giorgio (UQAM)
Plusieurs postes aux études supérieures sont disponibles pour la réalisation de thèses de maîtrise ou de doctorat au sein du groupe d’Écologie Aquatique de l’Université du Québec à Montréal (UQAM). Les projets seront associés à la Chaire sur la Biogéochimie du carbone des écosystèmes aquatiques boréaux, financée par le CRSNG (BiCÉAB/CarBBAS). Les projets de recherche peuvent porter sur un large éventail de questions liées à la biogéochimie du carbone et à la dynamique des gaz à effet de serre dans les écosystèmes aquatiques nordiques, notamment la transformation et la dynamique du carbone organique des lacs et des rivières, la dynamique des gaz à effet de serre et le métabolisme des écosystèmes; les liens entre la biogéochimie du carbone aquatique et terrestre et la fonction de l'écosystème; le rôle des écosystèmes aquatiques sur les budgets de carbone régionaux; la dynamique des gaz à effet de serre dans les réservoirs hydroélectriques et l’empreinte C de la production d’énergie hydroélectrique. Les projets impliqueront éventuellement une combinaison d'approches, notamment la mesure des gaz in situ, ponctuelle et en continu, des mesures chimiques et physiques, la caractérisation optique, isotopique et chimique de la matière organique, un large éventail de mesures de processus, des mesures de modélisation SIG et de modélisation du paysage et des techniques microbiennes moléculaires. La recherche privilégie une perspective intégratrice à l'échelle du réseau des eaux intérieures du biome boréal du Québec, mais des travaux comparatifs sur les systèmes tempérés et subarctiques au Québec et ailleurs seront également effectués.

Le ou la candidate se joindra à l’équipe très dynamique, diversifiée et multidisciplinaire de la Chaire de recherche industrielle en Biogéochimie du carbone des écosystèmes aquatiques boréaux ( BiCÉAB), financée par le CRSNG et partie prenante du groupe aquatique du Département des sciences biologiques de l’UQAM, qui possède une expertise collective en biogéochimie des éléments nutritifs et du carbone, des écosystèmes et modélisation du paysage, écologie des populations, des communautés et des écosystèmes, génomique et écologie moléculaire. Les étudiants intéressés doivent envoyer une lettre d’introduction, un curriculum vitae et les noms de deux références à Paul del Giorgio, del_giorgio.paul@uqam.ca, (514-795-7983). Les candidatures et demandes par courriel sont les bienvenues.
Date de début: Ouvert en tout temps